Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Q3U6N9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q3U6N9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Q3U6N9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q3U6N9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Q3U6N9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Q3U6N9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Q3U6N9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Q3U6N9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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