Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q3U595 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Q3U595 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U595 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U595 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U595 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U595 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U595 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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