Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms