Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms