Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms