Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms