Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms