Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms