Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca4Q3TKT4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms