Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms