Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl9Q32KG4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms