Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M3Q31093 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms