Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shroom4Q1W617 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms