Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd3Q14AI6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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