Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms