Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cntnap5cQ0V8T7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cntnap5cQ0V8T7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cntnap5cQ0V8T7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5cQ0V8T7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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