Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2bQ0KL01 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms