Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf541Q0GGX2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms