Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ncf1Q09014 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ncf1Q09014 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms