Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms