Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssrp1Q08943 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssrp1Q08943 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms