Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms