Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gata4Q08369 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms