Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms