Protein–RNA interactions for Protein: Q07230

Zscan2, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan2Q07230 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan2Q07230 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan2Q07230 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms