Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bp2Q06649 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp2Q06649 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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