Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mex3cQ05A36 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms