Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmn1Q05860 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms