Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms