Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms