Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nf1Q04690 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nf1Q04690 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms