Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smpd1Q04519 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms