Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms