Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnd1Q03719 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms