Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htr1fQ02284 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms