Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mc1rQ01727 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms