Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms