Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2aQ01320 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms