Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HmgcrQ01237 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms