Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms