Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms