Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp9bP98195 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp9bP98195 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms