Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd3P97770 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd3P97770 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms