Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms