Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smyd1P97443 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms