Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms