Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms