Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms