Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8a1P70704 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8a1P70704 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms