Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad50P70388 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms